Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DbtP53395 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DbtP53395 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DbtP53395 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DbtP53395 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DbtP53395 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DbtP53395 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DbtP53395 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DbtP53395 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DbtP53395 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DbtP53395 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DbtP53395 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DbtP53395 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DbtP53395 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DbtP53395 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DbtP53395 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DbtP53395 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DbtP53395 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DbtP53395 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DbtP53395 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DbtP53395 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DbtP53395 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DbtP53395 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DbtP53395 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DbtP53395 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DbtP53395 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DbtP53395 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DbtP53395 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DbtP53395 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DbtP53395 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DbtP53395 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DbtP53395 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DbtP53395 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DbtP53395 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DbtP53395 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DbtP53395 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DbtP53395 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DbtP53395 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DbtP53395 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DbtP53395 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DbtP53395 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DbtP53395 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DbtP53395 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DbtP53395 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DbtP53395 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DbtP53395 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DbtP53395 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DbtP53395 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DbtP53395 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DbtP53395 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DbtP53395 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DbtP53395 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DbtP53395 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DbtP53395 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DbtP53395 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DbtP53395 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DbtP53395 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DbtP53395 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DbtP53395 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DbtP53395 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DbtP53395 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DbtP53395 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DbtP53395 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbtP53395 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbtP53395 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbtP53395 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbtP53395 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbtP53395 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbtP53395 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DbtP53395 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbtP53395 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbtP53395 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DbtP53395 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DbtP53395 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DbtP53395 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DbtP53395 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DbtP53395 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DbtP53395 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DbtP53395 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DbtP53395 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DbtP53395 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DbtP53395 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DbtP53395 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DbtP53395 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DbtP53395 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DbtP53395 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DbtP53395 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DbtP53395 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DbtP53395 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DbtP53395 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms