Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RoraP51448 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RoraP51448 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RoraP51448 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RoraP51448 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RoraP51448 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RoraP51448 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RoraP51448 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RoraP51448 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RoraP51448 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RoraP51448 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RoraP51448 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RoraP51448 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RoraP51448 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RoraP51448 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RoraP51448 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RoraP51448 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RoraP51448 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RoraP51448 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RoraP51448 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RoraP51448 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RoraP51448 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RoraP51448 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RoraP51448 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RoraP51448 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RoraP51448 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RoraP51448 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RoraP51448 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RoraP51448 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RoraP51448 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RoraP51448 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RoraP51448 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RoraP51448 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RoraP51448 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RoraP51448 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RoraP51448 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RoraP51448 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RoraP51448 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RoraP51448 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RoraP51448 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RoraP51448 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RoraP51448 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RoraP51448 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RoraP51448 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RoraP51448 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RoraP51448 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RoraP51448 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RoraP51448 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RoraP51448 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RoraP51448 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RoraP51448 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RoraP51448 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RoraP51448 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RoraP51448 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RoraP51448 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RoraP51448 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RoraP51448 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RoraP51448 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RoraP51448 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RoraP51448 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RoraP51448 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RoraP51448 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RoraP51448 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RoraP51448 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RoraP51448 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RoraP51448 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RoraP51448 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RoraP51448 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RoraP51448 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RoraP51448 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RoraP51448 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RoraP51448 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RoraP51448 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RoraP51448 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RoraP51448 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RoraP51448 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RoraP51448 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RoraP51448 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RoraP51448 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RoraP51448 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RoraP51448 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RoraP51448 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RoraP51448 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RoraP51448 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RoraP51448 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RoraP51448 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RoraP51448 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RoraP51448 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RoraP51448 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RoraP51448 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms