Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt2P50752 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt2P50752 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnt2P50752 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt2P50752 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt2P50752 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt2P50752 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt2P50752 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt2P50752 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt2P50752 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt2P50752 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt2P50752 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt2P50752 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt2P50752 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt2P50752 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms