Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptx3P48759 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptx3P48759 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptx3P48759 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms