Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sipa1P46062 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sipa1P46062 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sipa1P46062 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sipa1P46062 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms