Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Defa-rs1P17533 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Defa-rs1P17533 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Defa-rs1P17533 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Defa-rs1P17533 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Defa-rs1P17533 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Defa-rs1P17533 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Defa-rs1P17533 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa-rs1P17533 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms