Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxc6P10629 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxc6P10629 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxc6P10629 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc6P10629 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hoxc6P10629 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc6P10629 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxc6P10629 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hoxc6P10629 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxc6P10629 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxc6P10629 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxc6P10629 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167 ms