Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoa4P06728 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoa4P06728 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa4P06728 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa4P06728 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.7 ms