Protein–RNA interactions for Protein: P03899

Mtnd3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd3P03899 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mtnd3P03899 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mtnd3P03899 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mtnd3P03899 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtnd3P03899 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtnd3P03899 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtnd3P03899 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtnd3P03899 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mtnd3P03899 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtnd3P03899 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtnd3P03899 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtnd3P03899 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtnd3P03899 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mtnd3P03899 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms