Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Opn1mwO35599 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Opn1mwO35599 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Opn1mwO35599 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Opn1mwO35599 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms