Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc23O35125 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc23O35125 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc23O35125 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc23O35125 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc23O35125 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc23O35125 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms