Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm42791D3YYB5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm42791D3YYB5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Gm42791D3YYB5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm42791D3YYB5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms