Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skint7A7XV04 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Skint7A7XV04 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Skint7A7XV04 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Skint7A7XV04 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Skint7A7XV04 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skint7A7XV04 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skint7A7XV04 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skint7A7XV04 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skint7A7XV04 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skint7A7XV04 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms