Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skint6A7XUZ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint6A7XUZ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skint6A7XUZ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Skint6A7XUZ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint6A7XUZ6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms