Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r232A2RTT5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r232A2RTT5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r232A2RTT5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms