Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lgr4A2ARI4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lgr4A2ARI4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr4A2ARI4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr4A2ARI4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr4A2ARI4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr4A2ARI4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr4A2ARI4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr4A2ARI4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr4A2ARI4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr4A2ARI4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms