Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RRP7BPQ9NSQ0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP7BPQ9NSQ0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms