Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT84Q9NSB2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms