Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms