Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITX2Q99697 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms