Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMIGD2Q96BF3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms