Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms