Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NCSTNQ92542 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms