Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC12Q8WUD4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC12Q8WUD4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms