Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYRIPQ8NFW9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms