Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACBD4Q8NC06 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms