Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD163Q86VB7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD163Q86VB7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms