Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
USP43Q70EL4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
USP43Q70EL4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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