Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BBS12Q6ZW61 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms