Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C16orf54Q6UWD8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms