Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RCSD1Q6JBY9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RCSD1Q6JBY9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms