Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARMIL1Q5VZK9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARMIL1Q5VZK9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms