Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFHC1Q5JVL4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms