Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00303Q3SY05 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms