Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LAMA4Q16363 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LAMA4Q16363 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
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