Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS72Q15906 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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