Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMD6Q15008 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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