Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NCAPHQ15003 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NCAPHQ15003 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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NCAPHQ15003 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NCAPHQ15003 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NCAPHQ15003 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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NCAPHQ15003 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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NCAPHQ15003 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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