Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSME4Q14997 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME4Q14997 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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