Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ODF1Q14990 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ODF1Q14990 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ODF1Q14990 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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