Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA1CQ13936 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CACNA1CQ13936 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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