Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP1A4Q13733 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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