Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PICALMQ13492 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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