Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE3BQ13370 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE3BQ13370 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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