Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2BQ13224 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
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