Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXF1Q12946 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXF1Q12946 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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