Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
TNP2Q05952 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms