Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP7AQ04656 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP7AQ04656 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms