Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC079598.2-201ENST00000599191 1294 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 MKRN1-211ENST00000480552 906 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms