Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLTCQ00610 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms